杨晟

发布者:生物统计学系发布时间:2017-07-18浏览次数:4797



杨晟,博士,副教授,硕导。20117月获南通大学预防医学专业学士学位,20167月获南京医科大学流行病与卫生统计学博士学位,导师:陈峰,同年留校任教。20202月完成密歇根大学安娜堡分校生物统计学系博士后,导师:Xiang Zhou。主要从事统计遗传学研究,以一作、通讯累计发表论文20余篇,其中包括Genome Med(2024)、Nucleic Acids Res(2024)、Brief Bioinform(2022)、Am J Hum Genet(2020)等领域优秀期刊。主持国家自然科学基金青年基金和面上项目、江苏省高校自然科学研究面上项目2项和江苏省青年托举工程,参与国家重点研发计划和国家自然科学基金国际合作与交流项目,开发SRT-Server、PGS-Depot、PGS-server和DBSLMM等计算工具、担任《南京医科大学学报(自然科学版)》青年编委和Genet Med统计学编委。



研究方向:统计遗传和生物信息学、大型人群队列数据分析


联系方式:

地址:南京市江宁区龙眠大道101号南京医科大学至诚楼G401

电话:025-86868436

邮箱:yangsheng@njmu.edu.cn


主要教学获奖(国家级和省部级):

1. 2023年 “挑战杯”全国大学生课外学术作品竞赛 省级二等奖

2. 2022年 全国大学生生命科学竞赛 三等奖 2项

3. 2021年 国家级大创2项

4. 2021年 全国大学生统计建模大赛 三等奖

5. 2021年 全国大学生SAS大赛 二等奖

6. 2020年 中国大学生计算机设计大赛 二等奖

7. 2020年 全国大学生生命科学创新创业大赛 二等奖

8. 2019年 全国大学生生命科学创新创业大赛 一等奖


在研项目:

1. 国家重点研发计划(2023YFC2306000) 重要病毒变异规律及预警研究 2023/12-2026/11 项目骨干

2. 国家自然科学基金面上项目(82273741) 基于贝叶斯层次模型在大型人群队列中构建多基因风险评分的方法学研究 2023/01-2026/12 主持

3. 国家自然科学基金国际合作与交流项目(12220101001)融合深度学习的疫情建模与多因素共演化的动力学机制研究 2023/01-2027/12 参与

4. 江苏省高校自然科学研究面上项目(22KJB330007) 整合注释信息构建遗传风险评分的统计方法研究 2022/07-2024/06 主持


代表性论文(“#”为第一或共同第一作者,“*为通讯作者及共同通讯作者)

理论研究和分析工具

1.Yang S#*, Zhou X*. SRT-Server: powering the analysis of spatial transcriptomic data. Genome Med. 2024 Jan 26;16(1):18. doi: 10.1186/s13073-024-01288-6.

2.Cao C#, Zhang S#, Wang J#, Tian M, Ji X, Huang D*, Yang S*, Gu N. PGS-Depot: a comprehensive resource for polygenic scores constructed by summary statistics based methods. Nucleic Acids Res. 2024 Jan 5;52(D1):D963-D971. doi: 10.1093/nar/gkad1029. 

3.Yang S#*, Zhou X*. PGS-server: accuracy, robustness and transferability of polygenic score methods for biobank scale studies. Brief Bioinform2022 Feb 22; doi: 10.1093/bib/bbac039.

4.Sun S#, Yang S*. Editorial: Integrative Analysis of Genome-Wide Association Studies and Single-Cell Sequencing Studies. Front Genet. 2021 Aug 27;12:752057. doi: 10.3389/fgene.2021.752057.

5.Yang S#, Zhou X*. Accurate and scalable construction of polygenic scores in large biobank data sets. Am J Hum Genet.2020 May 5; 106(5): 679-693. doi: 10.1016/j.ajhg.2020.03.013.


应用

1.Ye X#, Wang Y#, Zou Y, Tu J, Tang W, Yu R, Yang S*, Huang P*. Associations of socioeconomic status with infectious diseases mediated by lifestyle, environmental pollution and chronic comorbidities: a comprehensive evaluation based on UK Biobank. Infect Dis Poverty. 2023 Jan 30;12(1):5. doi: 10.1186/s40249-023-01056-5.