1996年，南京医科大学以“生殖医学”作为特色方向，通过多学科交叉组合，组建了生殖医学中心。1997年江苏省政府正式批准成立江苏省生殖医学重点实验室，2004年入选成为科技部和江苏省共建的国家重点实验室培育点。在2005、2007和2010年江苏省省级重点实验室检查评估中，实验室评估成绩优秀，2005年成为江苏省国家重点实验室培育建设点，2008年又成为国家人口和计划生育委员会生殖医学重点实验室，2011年3月生殖医学实验室被科技部批准立项筹建国家重点实验室,2013年顺利通过科技部组织的验收，正式成为国家重点实验室 。实验室目前共设4个主要研究方向，其中配子发生障碍的病理、生殖内分泌激素与相关疾病的研究方向由公共卫生学院主持。

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