南京医科大学预防医学专业是首批国家级特色专业、国家级人才培养模式创新实验区、江苏省品牌专业。拥有预防医学国家级实验教学示范中心、预防医学国家级教学团队、国家级精品课程和精品资源共享课、国家级精品视频公开课、国家级双语教学示范课程、国家级教学名师、教育部长江学者和创新团队、长江学者特聘教授、长江学者青年学者、全国百篇优秀博士论文指导教师、国家级创新团队等。实现了国家级“高等学校本科教学质量工程与教学改革工程”项目的全覆盖。在教育部最新的公共卫生与预防医学一级学科综合评估中（2012年）位列全国第三，“人才培养质量”一级指标位列全国第二，“教学与教材质量”二级指标位列全国第一。
基于“高水平、有特色、国内一流、国际知名”的专业发展目标，形成了“以公共卫生实践创新能力培养为主线，以优质教学资源为支撑，专业知识、创新能力、职业素养“三位一体”的人才培养模式，获2014年度国家级教学成果二等奖。
十三五期间专业建设的主要举措是：通过“专业认证国际化、师生视野国际化”提升国际化水平；通过“开放的教学手段、开放的实践平台”实现开放式办学；通过“研究型师资队伍、创新型研究人才”创建研究型专业。