肺癌新易感位点的发现及多基因遗传评分在肺癌风险预测中的应用--基于中国超大型前瞻性队列研究

发布者:公卫教研办发布时间:2019-07-25浏览次数:10

 

南医大公共卫生学院沈洪兵课题组

中国超大型前瞻性队列确证肺癌遗传易感位点在肺癌风险评估中的重要价值


 本项目在前期中国人群肺癌全基因组关联研究的基础上,进一步扩大研究样本量,并整合中-欧人群GWAS数据开展跨种族分析,阐明肺癌新的遗传易感位点;在此基础上,进一步构建中国人群肺癌多基因遗传风险评分(Polygenic risk scorePRS),并通过中国慢性病研究队列(China Kadoorie BiobankCKB)对遗传风险评分在肺癌高危人群筛查中的价值进行前瞻性评价。本研究共鉴定出19个肺癌遗传易感位点,其中6个为本研究首次发现。进一步分析上述19个位点在中-欧人群中的效应和频率,结果显示染色体3q285p15.336p21.115q25.119q13.28p129q33.27个区域遗传易感位点的频率/效应在不同人群间存在高度异质性(I2 ≥ 0.75P ≤ 1.0×10-4)。

 基于前期报道及本次研究发现,最终筛选出19个独立易感位点构建了中国人群肺癌多基因遗传风险评分PRS-19,结合CKB 9.5万人10年随访数据发现:随着遗传评分PRS-19的增加,肺癌发病风险显著增加,呈现明显的剂量-反应关系(P=2.02×10-9)。当以-5%5%-95%、和95%-定义低、中、高遗传风险人群时,我们发现三个人群肺癌发病风险存在明显差异,高风险人群肺癌发病率是低风险人群的2.37

(HR=2.37, 95% CI: 1.64-3.44)。此外,PRS-19与吸烟量存在累积效应,遗传高风险的中度吸烟者(吸烟包-PY<30)肺癌发病风险与遗传中风险的重度吸烟者(PY≥30)相近,提示该人群有望从肺癌筛查中获益。标化发病率结果显示,在低、中、高遗传风险人群中,随着吸烟量的增加肺癌发病风险均显著增加,且遗传低风险的重度吸烟者肺癌发病风险(244.7)要明显高于遗传高风险的非吸烟者(155.3),突出控烟在肺癌预防中的重要意义。本研究生迄今为止亚洲最大规模的肺癌全基因组关联研究,也是首次应用大规模前瞻性队列评价了多基因遗传风险评分PRS在肺癌发病风险分层中的应用效果,将为推动我国肺癌精准预防提供重要参考。

PRS-19在肺癌人群风险分层中的应用评价



时间:20197
刊物:THE LANCET Respiratory Medicine

标题:Identification of risk loci and a polygenic risk score for lung cancer: a large-scale prospective cohort study in Chinese populations